多式联运合同纠纷，是指承运人以两种以上的运输方式将托运人交付的货物运抵目的地而签订的合同中出现的纠纷。

《合同法》第17章对运输合同作出了专门规定在审理运输合同纠纷案件时，还需注意有关运输的单行立法的规定。如《铁路法》、《民用航空法》、《公路法》、《水路运输管理条例》等。《海商法》则专门适用于本案由规定的海书海商纠纷部分。